中医应用
1、用于湿热内蕴、肠胃湿热、呕吐、泻痢等症。配黄芩、大黄等，能治湿热内蕴之证。对湿热留恋肠胃，常配合半夏、竹茹；配木香、黄芩、葛根等以治泻痢。
2、用于温病高热、口渴烦躁、血热妄行、以及热毒疮疡等。治温病高热、心火亢盛，配伍栀子、连翘等；对于血热妄行，可配伍黄芩、大黄等同用；对热毒疮疡，可配伍赤芍、牡丹皮等药同用。此外，黄连还可用于胃火炽盛的中消证，可配合天花粉、知母、生地等同用；涂口，可治口舌生疮。
用法用量
煎服，2～5克。外用适量。
文献记载
《神农本草经》：味苦，寒。主治热气，目痛，眦伤，泣出，明目，肠澼，腹痛，下痢，妇人阴中肿痛。久服令人不忘。
《名医别录》：微寒，无毒。主治五藏冷热，久下泄澼、脓血，止消渴、大惊，除水，利骨，调胃，厚肠，益胆，治口疮。
《本草拾遗》：主羸瘦气急。
《药性论》：恶白僵蚕，忌猪肉，恶冷水。杀小儿疳虫，点赤眼昏痛，镇肝，去热毒。
《日华子本草》：治五劳七伤，益气，止心腹痛、惊悸、烦躁、润心肺、长肉、止血、并疮疥，盗汗，天行热疾。猪肚蒸为丸，治小儿疳气。
《开宝本草》：味苦，微寒，无毒。五脏冷热，久下泄澼、脓血，止消渴，大惊，除水利骨，调胃，厚肠，益胆，疗口疮。
《本草图经》：黄连治目方多，而羊肝丸尤奇异。盖眼目之病，皆血脉凝滞使然，故以行血药合黄连治之。血得热则行，故乘热洗也。
《本草衍义》：今人多用治痢，盖执以苦燥之义。下俚但见肠虚渗泄，微似有血便，即用之，更不知止。又不顾寒热多少，但以尽剂为度，由是多致危困。若气实初病，热多血痢，服之便止，仍不必尽剂也。或虚而冷，则不须服。余如《经》。
《药类法象》：泻心火，除脾胃中湿热，治烦躁恶心，郁热在中焦，兀兀欲吐。治心不痞满必用药也。仲景治九种心下痞，五等泻心汤皆用之。
《药性赋》：味苦，平，气寒，无毒。沉也，阴也。其用有四：泻心火，消心下痞满之状;主肠澼，除肠中混杂之红;治目疾暴发宜用,疗疮疡首尾俱同。
《汤液本草》：气寒，味苦。味厚气薄，阴中阳也。升也，无毒。
《象》云：泻心火，除脾胃中湿热，治烦躁恶心，郁热在中焦，兀兀欲吐，心下痞满必用药也。仲景治九种心下痞，五等泻心汤皆用之。去须用。
《心》云：泻心经之火，眼暴赤肿及诸疮，须用之。苦寒者主阳有余，苦以除之。安蛔，通寒格，疗下焦虚，坚肾。
《珍》云：酒炒上行，酒浸行上头。
《本草》云：主热气，目痛眦伤泣出，明目。肠澼腹痛下痢，妇人阴中肿痛。五脏冷热，久下泄澼脓血，止消渴大惊，除水利骨，调胃厚肠，益胆，疗口疮。久服令人不忘。
《液》云：入手少阴，苦燥，故入心，火就燥也。然泻心其实脾也，为子能令母实，实则泻其子。治血防风为上使，黄连为中使，地榆为下使。
海藏祖方，令终身不发斑疮：煎黄连一口，儿生未出声时，灌之，大应。已出声灌之，斑虽发，亦轻。古方以黄连为治痢之最。
《衍义》云：治痢有微血，不可执以黄连。为苦燥剂，虚者多致危困，实者宜用之。
《本草》又云：龙骨、理石、黄芩为之使，恶菊花、芫花、玄参、白鲜皮，畏款冬花，胜乌头，解巴豆毒。
《本草衍义补遗》：以姜汁炒辛散，除热有功。
《本草发挥》：成聊摄云：苦入心，寒除热。大黄、黄连之苦，以导泻心下之虚热。又云：上热者泄之以苦，黄连之苦以降阳。又云：蛔得甘则动，得苦则安，黄连、黄柏之苦以安蛔。
洁古云：泻心火，除脾胃中湿热，治烦躁恶心，郁热在中焦，兀兀欲吐。味苦，气味俱厚，可升可降，阴中阳也。其用有五：泻心热一也，去中焦火二也，诸疮必用三也，去风湿四也，赤眼暴发五也。酒炒则上行。又云：去中焦湿与热，用黄连泻心火故也。眼痛不可忍者，用黄连、当归根，酒浸煎服。宿食不消者，用黄连、枳实。
《本草纲目》：黄连大苦大寒，用之降火燥湿，中病即当止。岂可久服，使肃杀之气常行，而伐其发生冲和之气乎？歧伯言：五味入胃，各归所喜攻。久而增气，物代之常也。气增而久，夭之由也。王冰注：酸入肝为温，苦入心为热，辛入肺为清，咸入肾为寒，甘入脾为至阴而四气兼之，皆增其味而益其气，故各从本脏之气为用。所以久服黄连、苦参反热，从火化也，余味皆然。久则脏气偏胜，即有偏绝，则有暴夭之道。是以绝粒服饵之人不暴亡者，无五味偏助也。况眼疾本于肝热，肝与心为子母，心火，肝亦火也，肾孤脏也，人患一水不胜二火，岂可久服苦药，使心有所偏胜，是以火救火，其可乎？
黄连，治目及痢为要药。古方治痢，香连丸（木香、黄连）。姜连散（干姜伍）。变通丸（茱萸伍）。姜黄散（生姜伍）。治消渴用酒蒸黄连。治下血，大蒜伍。治口疮，细辛伍。皆一冷一热，一阴一阳，寒因热用，热因寒用，君臣相佐，阴阳相济，最得利方之妙，所以有成功而无偏胜之害也。
药方选录
1、治丈夫、妇人三焦积热．上焦有热 攻冲眼目赤肿 头项肿痛 口舌生疮；中焦有热 心膈烦躁 不美饮食；下焦有热 小便赤涩 大便秘结 五脏俱热 即生疽疖疮痍及五般痔疾 粪门肿痛 或下鲜血：黄连（去须、芦）、黄芩（去芦）、大黄（煨）各十两．上为细末炼蜜为丸 如梧桐子大．每服三十丸 用熟水吞》 如脏腑壅实 加服丸数．小儿积热 亦宜服之． （《局方》三黄丸）
2、治伤寒胸中有热 胃中有邪气 腹中痛 欲呕吐者：黄连150克 甘草150克（炙） 干姜150克 桂枝150克（去皮） 人参100克 半夏250克（洗） 大枣十二枚（擘）．上七味 以水一斗 煮取六升 去滓．温服 昼三夜二．（《伤寒论》黄连汤）
3、治心烦懊依反复 心乱 怔仲 上热 胸中气乱 心下痞闷 食入反出：朱砂20克 黄连25克 生甘草12.5克．为细末 汤浸 蒸饼丸如黍米大．每服一十九 食后时时津唾咽下．（《直指方》黄连安神丸）
4、治心经实热：黄连35克．水一盏半 煎一盏 食远温服 小儿减之．（《局方》泻心汤）
食疗营养
适合人群： 胃虚呕恶，脾虚泄泻，五更肾泻者，均慎服。
食疗作用： 黄连味苦、性寒，归心、肝、胃、大肠经，质坚味厚，降而微升；具有清热泻火，燥湿，解毒的功效。主治热病火热乙，高热烦躁，神昏谵语；心火亢盛，胸膈热闷，心烦失眠，口舌生疮；血热妄行，吐血，血块血；肝火目赤肿痛；胃热呕吐，消渴，牙龈肿痛；肠胃湿热，脘腹痞满，泄泻，痢疾；热毒疮疡，湿疹，烫伤。
药用禁忌
本品大苦大寒，过服久服易伤脾胃，脾胃虚寒者忌用。苦燥伤津，阴虚津伤者慎用。 胃虚呕恶，脾虚泄泻，五更肾泻，慎服。
1、《本草经集注》：恶菊花、芜花、玄参、白鲜；畏款冬。
2、《药性论》：恶白僵蚕，忌猪肉。
3、《蜀本草》：畏牛膝。'
4、《纲目》:黄连大苦大寒，用之降火燥湿，中病即当止，岂可久服，使肃杀之令常行，而伐其生发冲和之气乎？
5、《本草正》：黄连善泻心脾实火，虚热妄用，必致格阳，故寇宗荧日：虚而冷者，慎勿轻用；王海藏日：夏月久血痢不用黄连， 阴在内也。
6、《本草经疏》:凡病人血少气虚，脾胃薄弱，血不足，以致惊悸不眠，而兼烦热躁渴，及产后不眠，血虚发热，泄泻腹痛，小儿 痘疮，阳虚作泄，行浆后泄泻，老人睁胃虚寒作泻，阴虚人天明溏泄，病名肾泄，真阴不足，内热烦躁诸证，法咸忌之，犯之使人危 殆。
7、《本草新编》：黄连，味苦，寒，可升可降，阴也，无毒。入心与胞络。最泻火，亦能入肝。大约同引经之药，俱能入之，而入心，尤专经也。止吐利吞酸，善解口渴。治火眼甚神，能安心，止梦遗，定狂躁，除痞满，去妇人阴门作肿。治小儿食土作疳，解暑热、湿热、郁热，实有专功
